PDTS UII didukung dengan beberapa Laboratorium, diantaranya: Laboratorium Bahan Konstruksi Teknik, Mekanika Tanah, Jalan Raya, Struktur,  Komputasi dan GIS (Geographic Information System) yang sudah memiliki peralatan yang memadai, laboran yang trampil, serta tenaga ahli yang handal, sehingga mampu untuk menunjang kegiatan akademik, sebagai sarana untuk penelitian dosen dan mahasiswa. Laboratorium ini juga melayani jasa penelitian, dan kerjasama dengan luar insitusi, memberikan konsultasi/ jasa/supervisi, evaluasi, pengujian dan pelatihan baik kepada instansi swasta maupun pemerintah.